Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc4Q3UMB9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Washc4Q3UMB9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Washc4Q3UMB9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms