Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Upf3bQ3ULL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upf3bQ3ULL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms