Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smu1Q3UKJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smu1Q3UKJ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smu1Q3UKJ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms