Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Usp19Q3UJD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp19Q3UJD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp19Q3UJD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp19Q3UJD6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms