Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b2Q3UJB0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b2Q3UJB0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b2Q3UJB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sf3b2Q3UJB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms