Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndst1Q3UHN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndst1Q3UHN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms