Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mcrip1Q3UGS4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mcrip1Q3UGS4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mcrip1Q3UGS4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms