Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Yipf3Q3UDR8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Yipf3Q3UDR8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Yipf3Q3UDR8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms