Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm45902Q3UDN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm45902Q3UDN3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm45902Q3UDN3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms