Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trafd1Q3UDK1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trafd1Q3UDK1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trafd1Q3UDK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms