Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttll12Q3UDE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttll12Q3UDE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttll12Q3UDE2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms