Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pid1Q3UBG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pid1Q3UBG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pid1Q3UBG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms