Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3U6N9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3U6N9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3U6N9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U6N9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U6N9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms