Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasip1Q3U0S6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rasip1Q3U0S6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasip1Q3U0S6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms