Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hbq1bQ3U0A6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hbq1bQ3U0A6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hbq1bQ3U0A6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Hbq1bQ3U0A6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hbq1bQ3U0A6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hbq1bQ3U0A6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Hbq1bQ3U0A6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Hbq1bQ3U0A6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Hbq1bQ3U0A6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Hbq1bQ3U0A6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hbq1bQ3U0A6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms