Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp13a5Q3TYU2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp13a5Q3TYU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp13a5Q3TYU2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms