Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pbxip1Q3TVI8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pbxip1Q3TVI8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pbxip1Q3TVI8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms