Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9130409I23RikQ3TS87 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
9130409I23RikQ3TS87 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms