Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c3Q3TMP1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms