Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Echdc2Q3TLP5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc2Q3TLP5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc2Q3TLP5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc2Q3TLP5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms