Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nlrp4cQ3TKR3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms