Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa26Q3L180 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa26Q3L180 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa26Q3L180 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms