Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Edem3Q2HXL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Edem3Q2HXL6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Edem3Q2HXL6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms