Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tdrd9Q14BI7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tdrd9Q14BI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Tdrd9Q14BI7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Tdrd9Q14BI7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tdrd9Q14BI7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
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