Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtel1Q0VGM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtel1Q0VGM9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtel1Q0VGM9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms