Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc162pQ0VG85 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms