Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39dQ0VF76 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Ttc39dQ0VF76 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Ttc39dQ0VF76 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39dQ0VF76 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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