Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col19a1Q0VF58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col19a1Q0VF58 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col19a1Q0VF58 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms