Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal1Q0VBP7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisal1Q0VBP7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisal1Q0VBP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms