Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hif3aQ0VBL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hif3aQ0VBL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hif3aQ0VBL6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms