Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap5cQ0V8T7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap5cQ0V8T7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5cQ0V8T7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms