Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lrriq1Q0P5X1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lrriq1Q0P5X1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Lrriq1Q0P5X1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lrriq1Q0P5X1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lrriq1Q0P5X1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms