Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cnnm1Q0GA42 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnnm1Q0GA42 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnnm1Q0GA42 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms