Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc7a1Q09143 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc7a1Q09143 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc7a1Q09143 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms