Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cass4Q08EC4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cass4Q08EC4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms