Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F13bQ07968 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
F13bQ07968 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
F13bQ07968 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F13bQ07968 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F13bQ07968 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F13bQ07968 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F13bQ07968 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F13bQ07968 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms