Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MestQ07646 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MestQ07646 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MestQ07646 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MestQ07646 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MestQ07646 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MestQ07646 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MestQ07646 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MestQ07646 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MestQ07646 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MestQ07646 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MestQ07646 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MestQ07646 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MestQ07646 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MestQ07646 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MestQ07646 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms