Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn3Q07409 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntn3Q07409 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn3Q07409 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms