Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf4Q06507 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf4Q06507 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf4Q06507 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms