Protein–RNA interactions for Protein: Q06194

F8, Coagulation factor VIII, mousemouse

Predictions only

Length 2,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8Q06194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8Q06194 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8Q06194 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8Q06194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8Q06194 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8Q06194 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8Q06194 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8Q06194 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F8Q06194 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8Q06194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8Q06194 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8Q06194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8Q06194 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8Q06194 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8Q06194 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8Q06194 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8Q06194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8Q06194 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8Q06194 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8Q06194 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8Q06194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8Q06194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F8Q06194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
F8Q06194 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8Q06194 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
F8Q06194 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8Q06194 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8Q06194 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8Q06194 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8Q06194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8Q06194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8Q06194 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
F8Q06194 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8Q06194 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8Q06194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8Q06194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8Q06194 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8Q06194 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8Q06194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8Q06194 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8Q06194 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8Q06194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8Q06194 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8Q06194 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8Q06194 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8Q06194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8Q06194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8Q06194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
F8Q06194 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8Q06194 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms