Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc2Q05020 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms