Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox9Q04887 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox9Q04887 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox9Q04887 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms