Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CkbQ04447 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CkbQ04447 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CkbQ04447 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CkbQ04447 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms