Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnb1Q03717 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnb1Q03717 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnb1Q03717 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms