Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col6a2Q02788 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col6a2Q02788 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col6a2Q02788 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col6a2Q02788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col6a2Q02788 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col6a2Q02788 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms