Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcqQ02111 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcqQ02111 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms