Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VcpQ01853 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcpQ01853 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcpQ01853 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VcpQ01853 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VcpQ01853 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcpQ01853 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcpQ01853 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VcpQ01853 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms