Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nme2Q01768 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nme2Q01768 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nme2Q01768 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms