Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sec23aQ01405 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23aQ01405 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sec23aQ01405 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23aQ01405 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms