Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2aQ01320 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2aQ01320 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Top2aQ01320 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Top2aQ01320 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Top2aQ01320 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Top2aQ01320 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms